myPresto / MolDesk
視覚的かつ直感的に操作できる分子シミュレーションシステムです。短時間で効率的なモデリング計算が可能です。GPUを搭載したワークステーションにソフトウェアをインストールしてご提供していますので、煩雑なセットアップもなく、納品後すぐにご使用いただけます。
※myPrestoは、経済産業省およびNEDOから委託を受けて実施した「生体高分子立体構造情報解析」および「創薬加速に向けたタンパク質構造解析基盤技術開発」プロジェクトで研究開発した医薬品開発支援の分子シミュレーションシステムで、従来に比べて短時間で高精度・高能率で行うことができます。
myPresto５ホームページ(https://www.mypresto5.jp/)
| OS | Ubuntu 20.04LTS |
|---|---|
| CPU | Xeon(R) Gold 6242R プロセッサー (3.1GHz, 20Core, 35.75MB, 2933MHz) x2 |
| メモリ | 64GB DDR4 SDRAM(2933MHz, ECC, Registered, 8GBx8) デュアルプロセッサー用 |
| HDD | 4TBハードディスクドライブ(SATA, 7,200rpm) x4 |
| GPU | NVIDIA(R) T400 4GB, NVIDIA(R) RTX A6000 ※GPU複数選択可 |
| モニタ | HP Z24f G3 FHDプロフェッショナル液晶モニター (23.8インチ、FHD) |
| 消費電力 | 1125W 90%電源変換効率 電源装置 |
| ジョブ管理システム | Slurm（Simple Linux Utility for Resource Management） |
| MPI環境 | MPICH, OpenMPI |
| コンパイラ | oneAPI HPC, gcc, gfortran |
| リモート環境 | XRDP, X11VNC |
研究内容や使用用途、そして既存システムに応じて、Moslpaceとの連携などのカスタマイズにも対応しております。
※myPrestoは、経済産業省およびNEDOから委託を受けて実施した「生体高分子立体構造情報解析」および「創薬加速に向けたタンパク質構造解析基盤技術開発」プロジェクトで研究開発した医薬品開発支援の分子シミュレーションシステムで、従来に比べて短時間で高精度・高能率で行うことができます。
myPresto５ホームページ(https://www.mypresto5.jp/)